Arkeologiska museet i Agios Nikolaos ligger i norra delen av sjön Voulismeni gatan Paleologos, 74, bara några minuters promenad från centrum. Museet grundades 1970 och har en rik samling av arkeologiska fynd i prefekturen Lasithi.

Museet utställning placeras i åtta utställningshallar och täcker en stor period i historien från den neolitiska till den romerska eran. Museets samling omfattar keramik, stenskulpturer, statyer, husgeråd, olika begravnings artefakter, guldsmycken, brons och elfenben artefakter från en sällsynt barns begravning och mer.

Den mest imponerande utställning av museet är skallen av en ung man, som finns i den romerska kyrkogården i Potamos nära staden. Skallen går tillbaka till 1: a århundradet och krönt med en gyllene diadem i form av olivblad. I munnen av skallen var ett silvermynt från Polirinia (Västra Kreta), frisläppandet av vilka har daterats till regeringstiden av den romerska kejsaren Tiberius. Coin, enligt gammal tradition, transportören var tvungen att betala Charon själar till underjorden Hades över floden Styx.

Av särskilt intresse är de artefakter som upptäcktes under utgrävningarna av den minoiska kyrkogården i Agia Fotia. Detta är en förhistorisk begravningsplats, som konstaterades 260 Minoan gravar, är platsen för de största arkeologiska platser på Kreta. Grundades här i 1600 olika kärl som tillverkats utan användning av en drejskiva och hans stil liknar den kykladiska konst.

Presenteras i museet och artefakter från den minoiska bosättningen Myrtos, bland vilka den viktigaste anses vara "gudinna Myrtos" - ett fartyg i form av en kvinnofigur. Museet uppvisar också artefakter från den minoiska palatset i Malia, inklusive en vacker sten fartyget sjunker i form av Triton.

Arkeologiska museet i Agios Nikolaos är en av de viktigaste museerna på Kreta.