Idén om skapandet av det arkeologiska museet i staden Almeria har uppstått i den första halvan av 19-talet. Genom 1837 av närmast staden och dess omgivningar kloster lyckades dra tillbaka 196 målningar och gamla mynt och gravstenar, smycken och redskap, med anor från tiden för det arabiska kungadömet i Spanien. Men för ett antal okända orsaker öppnandet av museet vid den tidpunkten inte har ägt rum. Därefter har många av dessa artefakter gjorde museets samling utanför Almeria och även utomlands.

Kungörelse av den andra spanska republiken var det faktum att år 1933 i Almeria fortfarande öppnade arkeologiska museet, som är inrymt i byggandet av Research Institute. Den initiala samling av museets arkeologiska lämningar har hittats vid utgrävningar i Almeria och dess omgivningar. År 1934 har museet redan börjat samarbete med andra museisamlingar i landet. År 1979, i samband med utbyggnaden av museets samlingar flyttades till byggnaden, som inrymmer College of Saint Mary Jungfru del Mar.

1998 av arkitekterna Ignacio García Pedrosa och Angela Garcia de Paredes byggdes en ny byggnad på museet som uppfyller moderna krav. Interiören i den nya byggnaden, rymliga och ljusa tack vare ett omfattande system av naturligt ljus, en minimalistisk design, en tydlig geometriska linjer och spatial förmåga. Insamling av det arkeologiska museet i Almería finns utställningar från den paleolitiska perioden fram till moriska dominans av den iberiska halvön.