Under 1444 i utkanten av staden Borovsk, Kaluga-regionen, på den högsta punkten där floden rinner ut i floden Istrema Protva grundades manliga Pafnutyevo-Borovsky kloster. Klostret är uppkallad efter dess grundare - abboten Paphnutius.

Under 1467 i stället för träkyrkan byggdes av vit sten katedralen, som kallas jul. Därefter har domkyrkan inte bevarats. Nativity av Jungfru är känd för att målningen, som han var dekorerad - det var en av de första verk av stora Dionysius. Alla målningarna utfördes under ledning av Dionysios d.ä. Simonov klostret - Ikonnikov Mitrofan.

År 1586, under regeringstiden av tsaren Fjodor Ivanovitj, var domkyrkan revs och i dess ställe uppfördes en ny fem-kupol. Materialet för byggandet av grunden till den nya katedralen var vita stenblock med Dionysius fresker av det femtonde århundradet. Således, fragment av verk av Dionysius och Ikonnikov Mitrofan levde och lagras i Borovsk gren av Kaluga State Regional Museum och Central Museum of Ancient rysk kultur och konst. Andrei Rublev i Moskva.

I XVI-talet klostret var inhägnad stenmurar, började klostret för att fungera som en gränsfästning. I samma talet restes ett tempel av Jesu födelse med en sten matsal. År 1523 var klockstapeln byggdes, och 1688 ersattes den av klocktornet.

Murar och torn Pafnutyevo-Borovsky kloster tillhör byggnaderna XVI-XVII århundraden .  Det finns en version som George, arsenalen och bords tornet i klostret skapades av den berömde arkitekten, författare till White City byggnader i Moskva, Smolensk Kreml och Simonov klostret - Fyodor Savelyevich Horse .  Men experter i vår tid hävdar att muren Pafnutyevo-Borovsky klostret och den äldsta runda tornet, som överlever i dag, byggdes efter byggandet av katedralen och klocktornet av samma arkitekt .  Resten av tornet: Taynitskaya, George hade återställts efter förstörelsen av klostret i dagarna av de oroliga tider i 1635 Trofim Sharutin mästare, och den senaste tornet: Watchdog ingång och renoverades 1636 eller senare .  Det bör noteras att planen var en fästning utformad för att försvara golvet "pristupnaya" vägg, som är karakteristisk för de XIV-XV århundraden, d.v.s. . till .  Torn byggt på ett litet avstånd från varandra, genom utomhus sidan av fästningen har utformats för motstånd och samtidigt fungera som den centrala arkitektoniska fasaden av klostret . 

1610, polackerna försvarade klostret Prince Mikhail Volkonsky, men han tillfångatogs och brändes.

Under reformerna av patriarken Nikon, biskop Paul om Kolomna, munk Poliekt Borovsky och några andra ledare i klostret var emot kyrkan reformer. Därefter var de reformmotståndarna undertryckt, och biskop Paul om Kolomna och munk Poliekt Borovsky avrättades.

Efter reformerna av patriarken Nikon, började Pafnutyevo-Borovsky kloster att minska. Under regeringstiden av Katarina II i klostret lämnade 33 munkar och noviser, och nästan alla tillhörde Pafnutyevo-Borovsky kloster gårdar valdes. År 1812, den franska brände klostret, men efter branden återställdes.

År 1923 var egendom som tillhör Pafnutyevo-Borovsky kloster överförts till ledningen Glavmuzeyu, men snart var postat en straffkoloni, och efter - den lantbruksskola. År 1960, när restaureringen fann 194 vita stenblock, och bara en 29-minuters fragment av berättelser dekorativt måleri, med anor från början av sextonde århundradet.

År 1991 klostret gavs till den ryska ortodoxa kyrkan och i mars samma år öppnades. Relikerna av St. Paphnutius av Borovsk, grundare av klostret, lagras i katedralen i Födelsekyrkan.