Byggandet av den nya byggnaden i klostret Santa Clara i Coimbra lanserades 1649. Old Monastery, byggdes i slutet av XIII-talet, förstördes, och det beslutades att bygga en ny byggnad för nunnorna av beställa av Santa Clara.

Projektet har utvecklat en benediktinermunk av klostret och slottsarkitekten João Turriano, som ansvarar för byggandet av den kungliga arkitekten Mateus do Couto. Nybyggnation varade tillräckligt länge. I 1677 en ny byggnad i klostret, som blev känd som klostret Santa Clara-a-Nova, körde nunnor. 1696 kyrkan invigdes.

Huvud portal klosterkyrkan är dekorerad med den kungliga vapenskölden, som stöds av två änglar. Interiören i kyrkan är i barockstil. Kyrkan har ett skepp, transepten saknas. Sido kapell och huvud kapellet är dekorerad med 14 altartavlor av XVII-talet i stil med "Talya dorado" - altartavlor inramade i snidade och förgyllt trä. Dessutom har en ny kloster flyttade grav med resterna av drottning Isabella av Portugal, grundare av klostret. Efter makens död, kung Dinis, drottningen var i Coimbra klostret Santa Clara till hans död och begravdes där. Därför bland lokalbefolkningen detta kloster kallas klostret drottning Isabella. Graven med aska, gjorda av silver och kristall, som ligger nära de viktigaste altaret i kyrkan. Innan kyrkan står ett monument till drottning Isabella, av skulptören Antonio Teixeira Lopes på artonhundratalet.

År 1733 i klostret klostret byggdes i renässansstil. Byggandet av dessa gallerier som ansvarar för den ungerska arkitekten Carlos Mardel.