Judiska museet ligger i huset Wertheimer, en historisk byggnad, uppkallad efter den ungerska rabbinen Samson Wertheimer (1658-1724). Beslutet på grundval av det judiska museet i Eisenstadt gjordes 1969 i forumet för Institutet för judiska studier vid universitetet i Wien. Museet öppnades tre år senare, 1972.

Det judiska museet ligger på ett område på nästan 1000 kvadratmeter. meter och är uppdelat i flera utställningshallar.

Samtidigt besöka museet kan du se en privat synagoga, som ligger på första våningen i byggnaden. Denna lilla synagoga är en av de få som inte har lidit under "Kristallnatten" (eller "Night of Broken Glass") i November 1938. Det var den första storskaliga angrepp av nazisterna mot judarna. Den natten var en massiv våg av pogromer i territorium Tredje riket, förstördes 267 synagogor, dödade 91 judar, hundratals skadade och lemlästade, blev tusentals utsattes för förnedring och förolämpningar, var mer än 30.000 skickades till koncentrationsläger.

Dessutom erbjuder museet att bekanta sig med den permanenta utställningen ger en heltäckande bild av judiskt liv och historia av judar i Burgenland. I slutet av utställningen är en imponerande memorial hall, skapad till minne av de sju kända judiska samhällen i Burgenland.

Dessutom har museet ett bibliotek, som innehåller mer än 10.000 volymer. Några av böckerna är i museets permanenta utställning, i princip, är detta boken av 18th century. Dessutom har biblioteket en stor samling faksimilutgåvor av kända böcker. Av särskilt intresse är en värdefull samling av böcker i jiddisch.

Museet ligger i Untershtadt (Lower City), varifrån 1670 bosatte sig cirka 3000 judar drevs ut från Wien. Inte långt från museet finns två gamla judiska kyrkogården.