Arkeologiska museet i Komotini grundades officiellt 1962 och baseras på de arkeologiska samling, samlades en grupp elever en av stadens skolor, där, i själva verket, antika artefakter och lagras under åren 1937-1962. År 1962, samlingen inrymt i en separat byggnad, men på grund av den ständiga påfyllning av kassan av museet behövde en akut utvidgning av utställningen utrymme. Under åren 1968-1970 speciellt för museet ritat av den välkände arkitekten Konstadinidisa Apis ny byggnad uppfördes, som idag anses vara en av de mest imponerande moderna byggnader i staden.
Unika reliker utställda i det arkeologiska museet samlades hela Trakien, och täcka ett stort tid från den neolitiska till den bysantinska perioden, perfekt illustrerar historien om kulturen i regionen och betonar obestridliga påverkan på den av de gamla grekerna. Huvudutställningen omfattar fynd från förhistoriska boplatser, grekiska kolonierna, romerska bosättningar och kyrkogårdar. Utställningen presenteras i kronologisk ordning och i enlighet med den territoriella behörighet antika föremål.
Det arkeologiska museet i Komotini, kan du se keramik och brons, skulptur, smycken, mynt, vapen och grav artefakter och mycket mer. Det mest värdefulla objekt i samlingen är verkligen ett gyllene byst av den romerska kejsaren Septimius Severus (AD 193-211gg).
Sedan 1987, det arkeologiska museet regelbundet genomför utbildningsprogram för grund- och gymnasieskolor.
Idag det arkeologiska museet i Komotini - ett av de mest intressanta platserna i staden.