Zoo och Museum of Nature i Split donerades till staden på grund av början av XX-talet, flera värdefulla natur samlingar. Professor Umberto Dzhirometta 1923 tog upp frågan om skapandet av Museum of Natural History. Kommunfullmäktige Split tog ärendet till översynen och 1924 grundade den första museet och Dzhirometta blev dess ledare fram till sin död 1939.

Under de första åren av sin existens, var museet som ligger i en av de kommunala byggnaderna i stadens centrum. Snart utrymmet var inte tillräckligt, och museet flyttades till en av byggnaderna i parken Marjan. Tillsammans med museet öppnade en liten djurpark, som representerar vissa arter av inhemska och exotiska djur. För det första i det forna Jugoslavien Aquarium intill byggandet av museet byggdes extra utrymme. Flera år senare, den Oceanarium var stängda och omvandlas till en liten bur. Idag i Split Zoo har över 300 arter av djur.

Byggnaden i parken Marjan på fientligheterna i 1991 stängdes av säkerhetsskäl. Sedan flyttade museet i fästningen Gripe, och efter 1997 återvände han till Marian. Efter 2000, på begäran av de anställda till behoven hos museet har tilldelats en ny plats, med en total yta på cirka 1156 kvadratmeter, där museet inledde sitt arbete i januari 2002.

Före öppnandet av den nya direktören för museet omorganiserades museisamlingar och berättade flera nya exponeringar (t.ex. insamling av uppstoppade djur och fåglar, institutionen för geologi och paleontologi, entomologi, Institutionen för ryggradsdjur och ryggradslösa djur, etc.). Fördes också arbetet med att behandla och systematisering av utställningsföremålen, fältarbete i den centrala delen av Dalmatien, många utställningar på museet och utanför den. Dessutom deltar museet personal i ett stort antal vetenskapliga konferenser.

På bottenvåningen i museet är värd för en mängd utställningar, och på andra golv inrymma den permanenta utställningen. Vem som helst kan köpa museet ytterligare material på historien om museet och lokala naturhistoria.