När den spanska kolonialtrupper började erövringen av Peru, Cuzco var en av de bastioner makten i Inkariket. Dess invånare är våldsamt varas dubbel staden gått från hand till hand innan Inkorna retirerade 1536. Den katolska kyrkan reagerade mycket allvarligt till byggandet av katedralen i en sådan viktig kolonialstaden i regionen. Santo Domingo-katedralen, kallas katedralen antagandet av Jungfru Maria byggdes med omsorg och uppmärksamhet på detaljer, och det fortsatta byggandet av mer än ett sekel. Idag katedralen är en av de viktigaste och mest populära turistmålen i Cusco, och på grund av dess stora betydelse i historien om staden, och på grund av sin vackra arkitektur.

Under ankomsten av de spanska conquistadorerna i Cuzco, de viktigaste och mest framstående tempel i staden var Coricancha - tempel tillägnat solguden Inti. Många historiker tror att detta var den mest heliga tempel i Inkariket. Spanjorerna beslutade på platsen för templet i Inka att bygga sin katedral, och används samtidigt större delen av byggmaterialet, går igenom templet Coricancha. Idag kan besökarna fortfarande se en liten mängd av de förstörda väggarna i templet Inkornas nära baksidan av domkyrkan.

Den lilla kyrkan, känd som Triumph kyrkan, byggd 1536, strax efter det att staden erövrades. Men så snart de spanska myndigheterna i dessa områden fastställts, började staden att bygga en mycket mer storslagen och imponerande katedralen. Planer har utarbetats av den spanske arkitekten Juan Miguel de Veramendi. Katedralen byggdes i gotisk och renässansstil som var typisk för spanska religiös arkitektur vid den tidpunkten. Även om det finns vissa tecken på förekomst av Inka inflytande i den religiösa symboliken i byggnaden, bland annat huvudet av en jaguar på ytterdörren av katedralen. Byggandet av katedralen inleddes 1559. Merparten av befolkningen i Inkornas användes för tungt arbete under byggandet av templet.

I århundraden, blev katedralen hem för flera viktiga religiösa artefakter, inklusive den berömda statyn av Svarta Kristus, som förmörkas av ljusen under flera århundraden. Man tror att denna staty har hjälpt kyrkan överleva och kvarstår efter den förödande jordbävningen i 1650. Till höger finns ett stort torn i katedralen bell Maria Angola Bell, 2 meter lång, väger ca 6 ton. Hans ringande kan höras på ett avstånd av tjugo miles. Domkyrkan höll en imponerande samling av konst som spänner över flera århundraden, inklusive målningar i 1650, som är den äldsta i staden.