Arkeologiska museet i Osijek grundades 1877 och kallades Museum av den fria kungliga staden Osijek. Museet grundades på initiativ och på donationer (numismatiska samling, en samling av antika vapen och litteratur) köpman Franjo Sedlakovicha. År 1878 var det första intendent på museet utsett Andrei Kodrik. Under de första decennierna av museum fyllt enbart av donationer från förmögna och framstående medborgare i staden Osijek, som inkluderade Franjo Sedlakovich Carl Nuber, Josip Juraj Strossmayer, Emerick Hilda och Dr Karl Kollich. Denna samling har varit och är fortfarande den största donationen i historien om museet.

En av de berömda curatorer var Vjekoslav Celestin - intendent på museet sedan 1893. Han arbetade i museet nästan 43 år gammal, var en flitig arbetare och professionell. Detta bekräftar det faktum att han är känd museer i Kroatien och utomlands. Han utförde det mesta av arbetet: orolig slutförandet och presentationen av museets samlingar, genomfört en systematisk genomgång av dokumentationen, med utgångspunkt från den arkeologiska platsen och slutar etnografiska material. Celestine för sitt arbete med rätta anses vara en av grundarna av museet. I slutet av besittningsrätt av curator 1933 grundade han det arkeologiska Society Club "Moores" (1937 döptes Society of Friends of Antiquities "Moores"), vilket var ett viktigt bidrag till arbetet i museet.

Museum hela sin historia ofta bytt plats. Och sedan 1946, och i dag är det i Osijek Citadel - en fd kommunfullmäktige.

Under kriget var museet allvarligt skadad, men lyckligtvis har hela samlingen var nästan orörd. Den värsta skadorna orsakades av regn insamling och olämplig förvaring. Den permanenta utställningen fördes till en säker plats. Men under ständig beskjutning, har arbetet på museet avbrutits. År 1994 fick museet fått status som en nationell institution.